По умолчанию MySQL-сервер в Ubuntu "слушает" только на localhost (127.0.0.1). Это значит, что он будет принимать подключения только от локальных приложений.
Чтобы изменить ситуацию (например, для управления базами с соседней машины), откройте файл /etc/mysql/my.cnf и закомментируйте строку